Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprnQ60673 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms