Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms