Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms