Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a3Q5XF89 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms