Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brip1Q5SXJ3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms