Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms