Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms