Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd40Q5SUE8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms