Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam71bQ5STT6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms