Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp18Q5SSI6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms