Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav8d-2Q5R1B6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms