Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1810065E05RikQ5NC41 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms