Protein–RNA interactions for Protein: Q5M956

Kctd1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd1Q5M956 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kctd1Q5M956 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kctd1Q5M956 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kctd1Q5M956 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kctd1Q5M956 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kctd1Q5M956 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kctd1Q5M956 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kctd1Q5M956 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms