Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm3Q5F4S9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms