Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Znf608Q56A10 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf608Q56A10 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms