Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CenpjQ569L8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CenpjQ569L8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CenpjQ569L8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms