Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prune2Q52KR3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prune2Q52KR3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms