Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opa3Q505D7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opa3Q505D7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opa3Q505D7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opa3Q505D7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opa3Q505D7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opa3Q505D7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opa3Q505D7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms