Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1qtnf9Q4ZJN1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1qtnf9Q4ZJN1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1qtnf9Q4ZJN1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1qtnf9Q4ZJN1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1qtnf9Q4ZJN1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1qtnf9Q4ZJN1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1qtnf9Q4ZJN1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms