Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc84Q4VA36 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms