Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhox3aQ4TU90 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhox3aQ4TU90 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms