Protein–RNA interactions for Protein: Q4FJU9

Tmem40, Transmembrane protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem40Q4FJU9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem40Q4FJU9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem40Q4FJU9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms