Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt35Q497I4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms