Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Fam220aQ3ZN08 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Fam220aQ3ZN08 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Fam220aQ3ZN08 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Fam220aQ3ZN08 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Fam220aQ3ZN08 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Fam220aQ3ZN08 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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