Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc185Q3V118 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc185Q3V118 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms