Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim9Q3V0X1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim9Q3V0X1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms