Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms