Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms