Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms