Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms