Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms