Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.1 ms