Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnrc6cQ3UHC0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms