Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rrp36Q3UFY0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms