Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Garem1Q3UFT3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms