Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttll12Q3UDE2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms