Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Rnf166Q3U9F6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rnf166Q3U9F6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rnf166Q3U9F6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rnf166Q3U9F6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rnf166Q3U9F6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf166Q3U9F6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf166Q3U9F6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf166Q3U9F6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rnf166Q3U9F6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rnf166Q3U9F6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rnf166Q3U9F6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf166Q3U9F6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rnf166Q3U9F6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Rnf166Q3U9F6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Rnf166Q3U9F6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf166Q3U9F6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms