Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hectd3Q3U487 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms