Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms