Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pag1Q3U1F9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms