Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.8 ms