Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.8 ms