Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc28Q3TX51 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc28Q3TX51 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc28Q3TX51 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc28Q3TX51 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc28Q3TX51 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc28Q3TX51 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc28Q3TX51 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc28Q3TX51 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc28Q3TX51 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc28Q3TX51 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc28Q3TX51 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc28Q3TX51 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc28Q3TX51 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms