Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pnpla6Q3TRM4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pnpla6Q3TRM4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pnpla6Q3TRM4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pnpla6Q3TRM4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pnpla6Q3TRM4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pnpla6Q3TRM4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pnpla6Q3TRM4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pnpla6Q3TRM4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms