Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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