Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Smarca4Q3TKT4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms