Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms