Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zfp444Q3TDV8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp444Q3TDV8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp444Q3TDV8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp444Q3TDV8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp444Q3TDV8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp444Q3TDV8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp444Q3TDV8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp444Q3TDV8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp444Q3TDV8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp444Q3TDV8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp444Q3TDV8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp444Q3TDV8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp444Q3TDV8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp444Q3TDV8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp444Q3TDV8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp444Q3TDV8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms