Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms