Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9I3

Gm1968, Predicted gene 1968, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1968Q3T9I3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm1968Q3T9I3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm1968Q3T9I3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm1968Q3T9I3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm1968Q3T9I3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm1968Q3T9I3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms